בחירת כלי החיתוך דורשת הערכה מקיפה של גורמים שונים, לרבות תכונות החומר המעובד, הצורה והמידות של חומר העבודה ודרישות עיבוד ספציפיות. חומר הכלי צריך להיות תואם לחומר העבודה; לדוגמה, כלי קרביד מומלצים לחומרים בעלי קשיות- גבוהה כגון פלדה, בעוד שכלי פלדה מהירים- מתאימים לחומרים רכים יותר כמו סגסוגות אלומיניום. הנחיות ספציפיות לבחירת כלים קיימות גם עבור חומרים כגון סגסוגות נחושת, גרפיט, סגסוגות אלומיניום ושרף.
יש להתאים את הגיאומטריה של כלי החיתוך לצורת חומר העבודה; לדוגמה, כרסמות קצה שטוחות -בדרך כלל נבחרות לטחינה מישורית, בעוד שפריסת קצה- כדורית או קצה מחודד מועדפים עבור כרסום משטחים מעוקלים. בפעולות חריצים, בחירת הכלים נקבעת בעיקר על ידי רוחב ועומק החריץ הנדרשים; בהתאם לפרופיל החריץ הספציפי, האפשרויות עשויות לכלול חותכי כרסום צדדיים, כרסום קצה או חותכי כרסום- ארוכים.
יש להתאים את מידות הכלי למידות חומר העבודה; באופן ספציפי, קוטר הכלי צריך להיות מעט קטן יותר מקצבת העיבוד של חומר העבודה כדי להבטיח גם איכות עיבוד ויעילות חיתוך. קטרים סטנדרטיים נפוצים עבור חותכי כרסום כוללים 2 מ"מ, 3 מ"מ, 4 מ"מ, 5 מ"מ, 6 מ"מ, 8 מ"מ, 10 מ"מ, 12 מ"מ, 16 מ"מ ו-20 מ"מ.
בעת שימוש בכלי חיתוך, הרכבה נכונה ומאובטחת חיונית כדי להבטיח חיבור יציב ואמין בין הכלי למחזיק הכלי. כלים חייבים להישמר חדים באמצעות השחזה קבועה, ובכך לשמור על הסימטריה והאיזון של קצוות החיתוך.
השימוש בכלי חייב להקפיד על פרמטרי חיתוך שצוינו, כולל מהירות חיתוך, קצב הזנה ועומק חיתוך. עבור פעולות כרסום קצה, מהירות הציר (RPM) מחושבת באמצעות הנוסחה: N=(1000 × V) / (π × D).
הפעלת מכונת כרסום דורשת הקפדה על פרוטוקולי בטיחות. לפני תחילת העבודה, יש לבדוק את כל מערכות המכונות כדי לוודא שהן בטוחות ומתפקדות במלואן. מחזיקי כלים וחלקי עבודה חייבים להיות מהודקים היטב; כמו כן, אסור בהחלט לבצע מדידות או לגעת במשטח המעובד בידיים בזמן שהמכונה פועלת. בעת הרכבה או הורדה של כרסמות קצה, יש להניח גוש עץ או רפידת הגנה על משטח שולחן המכונה; תמיכה ידנית של ראש החותך בידיים אסורה.
לגבי בלאי הכלים, קיימות שיטות הערכה ספציפיות להערכת הבלאי בקצוות החיתוך התחתונים של כרסמות קצה גליליות; שיטות אלו מאפשרות קביעת מדדי הערכה מרכזיים, כגון שטח אזור הבלאי וגובה רצועת הבלאי. על ידי שיפור מבנה הכלים-כגון שילוב חיספוס, גימור וצחצוח שיניים בחותכי כרסום חוטים המיועדים לבלאי- בחומרים-גבוהים, ניתן להפחית כדי להאריך את חיי הכלים.
